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廣西防城港市HIV-1流行株env基因C2V3區(qū)序列特征及亞型分析

作者:勞飛翔; 莫實德; 鄧培雪; 黃潔潔; 梁林盼; 黎玲莉; 廖瑋; 梁冰玉; 葉力 廣西醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院廣西艾滋病防治研究重點實驗室; 南寧530021; 防城港市疾病預防控制中心; 廣西醫(yī)科大學生命科學研究院

摘要:目的了解近期防城港市HIV-1流行毒株env基因C2V3區(qū)亞型及分布特征,為防城港市防治艾滋病工作提供科學依據(jù)。方法于2017年10月~2018年4月在防城港市人民醫(yī)院收集199例定點隨訪的接受抗病毒治療的HIV感染者或艾滋病病人(human immunodeficiency virus/acquired immunodeficiency syndrome,HIV/AIDS)的流行病學調查信息和10 ml外周血。從外周血白細胞中提取前病毒DNA,用巢式聚合酶鏈反應對獲得的HIV-1前病毒DNA env C2V3區(qū)基因片段進行擴增,并進行DNA測序,獲得的DNA序列信息使用Sequencher 5.1、MEGA 5.0軟件進行清理和分析。結果本研究共收集199例HIV/AIDS,其人口學特征主要以年齡18~49歲為主,占53.70%;職業(yè)以農民和待業(yè)為主,分別占42.59%、45.37%;學歷以初中及以下為主,占89.81%;民族以漢族為主,占75.93%;傳播途徑以異性傳播為主,占93.52%。成功擴增HIV-1env C2V3區(qū)基因108例,其中CRF01AE(Circulating Recombinant Forms,CRF)亞型103例,CRF BC亞型3例,B、CRF5901B亞型各1例。發(fā)現(xiàn)8種gp120 V3環(huán)頂端四肽,其中以GPGQ為主,占50.00%;其次為GPGR和GPGK,分別占22.22%、12.96%。預測輔助受體為CXCR4(chemo-kine receptor 4) 59例,占54.63%;其次是CCR5輔助受體(chemo-kine receptor 5)30例,占27.78%;CXCR4/CCR5輔助受體19例,占17.59%。結論防城港市主要流行HIV-1 CRF01AE亞型,其流行毒株亞型存在多態(tài)性。防城港市HIV-1型CRF01AE毒株膜區(qū)V3環(huán)氨基酸頂端四肽存在較高的多態(tài)性,使用CXCR4輔助受體的HIV-1毒株比例高于用CCR5輔助受體的毒株。

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醫(yī)學動物防制雜志

醫(yī)學動物防制雜志, 月刊,本刊重視學術導向,堅持科學性、學術性、先進性、創(chuàng)新性,刊載內容涉及的欄目:論著、實驗研究、調查研究、檢驗技術等。于1984年經新聞總署批準的正規(guī)刊物。

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