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大鯢Agouti基因的克隆、表達及多態(tài)性分析

作者:姜維; 鄧捷; 王啟軍; 趙虎; 孔飛; 張紅星 陜西省動物研究所; 陜西省秦嶺珍稀瀕危動物保育重點實驗室; 西安710032

摘要:刺鼠信號蛋白(Agouti)是哺乳動物和鳥類黑色素合成過程中的重要調(diào)控因子,影響動物的體色(毛色)。為研究Agouti在兩棲動物體色形成過程中的作用,本研究利用PCR技術擴增得到大鯢Andrias davidianus的Agouti基因部分cDNA序列并進行了相關的生物信息學分析,進一步使用實時熒光定量PCR檢測了大鯢Agouti基因在皮膚、肝臟等10個組織和器官中的表達情況,并檢測了4種不同體色大鯢皮膚組織中Agouti基因的表達量。同時采用直接測序法,比較了不同體色大鯢Agouti基因編碼區(qū)的序列差異。結果顯示,大鯢Agouti基因cDNA序列長1 068 bp,開放閱讀框399 bp,編碼132個氨基酸殘基。蛋白質(zhì)同源性分析表明,大鯢Agouti蛋白具有與其他物種一致的保守Agouti結構域,其蛋白質(zhì)序列與兩棲爬行類序列相似性較高,與哺乳動物和鳥類相似性較低。系統(tǒng)進化分析顯示,大鯢Agouti基因與高山倭蛙Nanorana parkeri、美國短吻鱷Alligator mississippiensis、中華鱉Pelodiscus sinensis等物種的親緣關系較近。實時熒光定量PCR分析表明,Agouti基因mRNA在大鯢不同組織中均有表達,皮膚中的表達量最高。在4種不同體色大鯢皮膚組織中,黃色皮膚中的Agouti基因表達量高于其他體色。不同體色大鯢Agouti基因編碼區(qū)序列一致。大鯢Agouti基因獨特的序列特征及其表達的組織特異性暗示了其在兩棲動物體色形成過程中可能具有與其他物種不同的調(diào)控機制。這些結果為進一步研究Agouti在大鯢體色形成過程中的作用提供了基礎資料。

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