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我國部分新型布尼亞病毒分離株全基因組序列分析

作者:劉秀蘭; 姚學(xué)君; 張雪峰; 管書慧; 姜仁杰 鹽城市疾病預(yù)防控制中心; 江蘇鹽城224100; 江蘇省疾病預(yù)防控制中心

摘要:目的 分析我國新型布尼亞病毒分離株全基因組序列,了解遺傳進(jìn)化特點(diǎn)。 方法 利用DNA STAR和MEGA 6.0軟件,對GenBank數(shù)據(jù)庫收錄的我國75株分離株全基因組序列進(jìn)行分析,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,并對毒株核苷酸和氨基酸突變位點(diǎn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。 結(jié)果 75株新型布尼亞病毒分離株流行優(yōu)勢株為基因型C;分離株核苷酸堿基突變總數(shù)合計(jì)5 938 bp,主要為堿基轉(zhuǎn)換(占79.86%);氨基酸間突變總數(shù)合計(jì)3 304 aa。 結(jié)論 我國新型布尼亞病毒全基因組序列系統(tǒng)進(jìn)化樹具有相似的拓補(bǔ)結(jié)構(gòu)。

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江蘇預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志, 雙月刊,本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向,堅(jiān)持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進(jìn)性、創(chuàng)新性,刊載內(nèi)容涉及的欄目:疾病防治、論著、衛(wèi)生管理與健康促進(jìn)、衛(wèi)生監(jiān)督監(jiān)測、少兒婦幼衛(wèi)生、綜述、專題論著、衛(wèi)生檢驗(yàn)與實(shí)驗(yàn)研究、性病艾滋病防治等。于1990年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。

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