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基于Gadgetron平臺的多GPU分布式磁共振圖像重建

作者:徐嘉文; 徐健; 周曉東; 張聰; 陳群 高端醫(yī)學影像技術(shù)研究中心(中國科學院上海高等研究院); 上海201210; 中國科學院大學; 北京100049; 上海聯(lián)影醫(yī)療科技有限公司; 上海201807

摘要:為了滿足磁共振成像(MRI)臨床掃描的需求,磁共振圖像重建算法的開發(fā)一直在不斷進行.目前廣泛使用的算法實現(xiàn)方式是利用中央處理器(CPU)對磁共振掃描數(shù)據(jù)進行數(shù)學變換得到圖像,隨著算法復雜度的提升,計算性能問題逐漸顯露.利用CPU在大數(shù)據(jù)量下執(zhí)行復雜算法時,計算并行性的缺失以及運算中產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)的存儲負荷會導致計算變得極為緩慢,使得一些算法因為重建時間過長,在臨床上面臨難以推廣的問題,也制約了基礎(chǔ)研究中新算法的研發(fā).本文設(shè)計并實現(xiàn)了一種新的重建算法執(zhí)行方式,利用Gadgetron磁共振軟件重建平臺在多核CPU基礎(chǔ)上搭載多塊圖形處理器(GPU),將磁共振圖像重建以分布式并行計算方式實現(xiàn),并以重建耗時較長的3D徑向數(shù)據(jù)采集Stack of Star(SOS)的圖像重建為實例,展示這種重建的實現(xiàn)方法能以相對低廉的硬件成本極大提升重建的速度.

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